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公开(公告)号：CN112786105A
公开(公告)日：2021-05-11
申请号：CN202011415023.0
申请日：2020-12-07
Applicant: 中山大学附属第五医院 , 南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种以半胰蛋白酶多肽为中心的宏蛋白质组数据挖掘方法，包括两步搜库、从头测序、开放式检索和多种搜库软件匹配，针对高分辨率质谱数据进行大规模的以半胰蛋白酶肽为中心的宏蛋白质组信息挖掘。这些策略可以减少因数据库不完整和翻译后修饰而产生的假阳性率。使用本发明的方法在分析大肠杆菌蛋白质组时，从一个巨大的宏蛋白数据库中鉴定出的肽段有93.4％与传统大肠杆菌参考数据库鉴定出的肽段相一致。
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公开(公告)号：CN112786105B
公开(公告)日：2024-05-07
申请号：CN202011415023.0
申请日：2020-12-07
Applicant: 中山大学附属第五医院 , 南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种以半胰蛋白酶多肽为中心的宏蛋白质组数据挖掘方法，包括两步搜库、从头测序、开放式检索和多种搜库软件匹配，针对高分辨率质谱数据进行大规模的以半胰蛋白酶肽为中心的宏蛋白质组信息挖掘。这些策略可以减少因数据库不完整和翻译后修饰而产生的假阳性率。使用本发明的方法在分析大肠杆菌蛋白质组时，从一个巨大的宏蛋白数据库中鉴定出的肽段有93.4％与传统大肠杆菌参考数据库鉴定出的肽段相一致。
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公开(公告)号：CN119943162A
公开(公告)日：2025-05-06
申请号：CN202411892203.6
申请日：2024-12-20
Applicant: 中山大学附属第五医院
Abstract: 本申请提供了一种基于空间组学的标志物筛选系统、方法、设备及其介质，通过空间映射模块和空间分析模块，空间映射模块用于获取目标分子类型、目标样品的空间组学数据集和空间位置数据集，并根据目标分子类型、空间组学数据集和空间位置数据集，对目标样品进行空间映射，得到目标样品的分子分布数据并绘制分子分布图；空间分析模块用于，获取目标研究疾病的病理信息和多个分子分布图，并根据病理信息在各个分子分布图中确定目标分析区域，然后，根据统计检验方法，对各个目标分析区域的分子进行差异分析，得到差异分子并将其确定为目标研究疾病的候选标志物，进而能够检测出因均质化而掩盖的低丰度标志物，为研究的疾病提供丰富的潜在标志物。
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