公开(公告)号：CN116083531A

公开(公告)日：2023-05-09

申请号：CN202310082830.2

申请日：2023-01-18

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 康亚妮 ,  文柏清 ,  张伟伟 ,  张飞 ,  何梦菊 ,  张博涵

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了一种精准分析单细胞APA位点的sc3T‑seq方法，涉及分子生物学和生物信息学领域，oligo(dT)20引物与链霉亲和素的磁珠孵育结合，加入少量起始样本和外源单链DNA，双链cDNA合成，双链cDNA断裂，移除polyA，释放带标签的cDNA，加入具有生物素标记的λ‑DNA，加入羧基磁珠，筛选去除外源cDNA，末端修复、加接头、构建cDNA文库，链霉素亲和磁珠去除生物素标记λDNA，得到纯净的样本文库。本发明降低了起始样品量，使分析APA位点的实验技术能够适用于少量样本甚至单个细胞，对于精准检测、分析细胞特异性的APA有很大的作用。

公开(公告)号：CN116106540A

公开(公告)日：2023-05-12

申请号：CN202310145143.0

申请日：2023-02-21

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 邵志峰 ,  文柏清 ,  张倪 ,  闫方 ,  李小卫 ,  孙洁林 ,  康亚妮 ,  程酩

IPC: G01N33/535 ,  G01N33/569 ,  G01N23/223 ,  G01N21/78 ,  G01N33/58

Abstract: 本发明提供了一种用于生物大组织高分辨率成像的标记方法，具体的，本发明提供了一种对组织样本进行均匀可控性免疫标记的方法。本发明的方法可同时解决特异性标记、大尺度样本均匀标记和反差强度可控三个问题，实现对生物大组织高分辨率成像的特定结构标记。