本发明公开了一种利用具有调节肠道菌群能力的高产GABA短乳杆菌菌株在生产植物基发酵乳中的应用，属于食品生物技术领域。本发明提供了短乳杆菌CGMCCNO.14385在制备抗氧化保健品、药品或改善胃肠道菌群保健品、缓解和/或治疗高脂饮食导致的肥胖的药品中的应用，该菌株能适应各种不同类型的植物基发酵乳的生产。在不添加其它任何培养基组分情况下，该菌株发酵酶解燕麦乳产生499mg/L的GABA。该菌株适合冻干以制作直投式菌剂并进行直投式发酵。短乳杆菌D17无潜在的毒力因子和耐药风险，对小鼠无毒害，且具有优良的肥胖延缓功效，能显著降低高脂膳食导致的体重增加，在植物基发酵和其他食品生产中具有重要的应用价值。