本发明公开了一种气动离合器执行机构位移控制方法及系统。本发明通过监测离合器执行机构压力腔内的压力大小、进排气电磁阀的开关状态和预存初始位移值确定执行机构的初始估计位移，通过监测离合器执行机构压力腔内的压力大小、压力变化量、进排气阀的开关状态、车辆行驶状态确定离合器执行机构位移变化量，通过监测离合器执行机构压力腔内的压力大小，变速器输出轴转速、变速器输入轴转速、转速变化量、当前挡位状态和预存离合器半结合点位移值校准与估计离合器执行机构相应估计位移值。本发明提高了原系统的抗电场、磁场干扰能力、提高了系统抗高温能力。