本发明公开了一种复合菌剂及其在生产纳豆制品中的应用，包括：保藏号为CCTCC M 2024903的贝莱斯芽孢杆菌（Bacillus velezensis）BV702和戊糖片球菌（P.pentosaceus）；用于生产纳豆、冻干纳豆或纳豆酱；本发明的复合菌剂发酵制备的纳豆产品口感顺滑、细腻，风味极佳，营养丰富，并且纳豆激酶活性较高，其中纳豆中纳豆激酶活性最终可维持在3000 U/mL以上，冻干纳豆口感极佳，并具有良好的稳定性，在4℃或者‑20℃条件下保藏21天后纳豆激酶酶活依然较高；纳豆酱呈金黄色，均匀无杂质，且酱香味浓郁，无明显氨臭味，且保留了纳豆的风味。纳豆酱中纳豆激酶酶活最终可维持在1400 U/mL以上，冻干纳豆中纳豆激酶酶活最终可维持在2859.5 U/mL以上。