本发明公开了一种多视频裁剪拼接方法、系统、电子设备和存储介质，涉及视频拼接技术领域，方法包括：通过无人机分段拍摄整个待建高速公路的地理环境的视频并进行预处理，计算每段待拼接视频的平均经纬度或经纬度中值，并按照从小到大的顺序对所有待拼接视频进行排序，得到第一视频序列；依次比较第一视频序列中每相邻两段待拼接视频，删除被完全包含的待拼接视频，对剩余的每段待拼接视频进行排序，得到第二视频序列，基于第二视频序列以及第二视频序列中的每段待拼接视频中的每帧图像的经纬度、偏航角和俯仰角进行视频拼接，本发明在拼接过程中，对视频中的重复的部分进行删除，同时去除视频中出现的无人机盘旋、俯仰、偏航等异常情况。