本发明公开了一种柱状沉积物自动切割器及其切割检测方法，该自动切割器包括：沉积物管、切割机构、检测装置。沉积物管整体呈中空圆柱状，分为可拆卸的主管和副管，副管上还具有多个调节孔；切割机构包括：传动装置、切割装置、驱动装置，驱动装置通过传动装置使切割装置沿轴线方向在沉积物腔内轴线切割；检测装置可拆卸的安装在切割刀具上，随着切割装置运动对沉积物进行实时检测，通过与从调节孔获取的样本数据对比，验证实施检测数据有效性。本发明具有结构简单，自动切割检测方便，实验数据可靠的优点。