本发明属于燃料电池技术领域，公开了一种燃料电池系统、燃料电池系统控制方法及车辆。该燃料电池系统包括电堆组件、部分氧化重整器以及引射器。该部分氧化重整器设置于该电堆组件的前端，连通该电堆组件的阳极入口，被配置为重整燃气并向该阳极入口提供重整后的阳极反应气。该电堆组件的阴极出口连通于该部分氧化重整器，该引射器设置于该电堆组件的阴极出口和该部分氧化重整器之间，能够利用重整空气将该电堆组件的至少部分阴极排气引射循环至该部分氧化重整器中，以为该部分氧化重整器提供重整热量和氧化剂。该燃料电池系统能够简化结构组成，提高可靠性，降低故障概率，且能够对阴极排出气进行循环利用，有效提升燃料利用率。