本发明涉及一种调控血清尿毒症毒素的复合益生菌、益生菌剂及其应用，所述调控血清尿毒症毒素的复合益生菌由鼠李糖乳杆菌Lactobacillus rhamnosus LRa66菌株和两歧双歧杆菌Bifidobacterium bifidum BBi32菌株组成。两种菌株存在潜在的相互作用，能够相互配合，在调控血清尿毒症毒素、缓解慢性肾病的功效上协同增效，具体体现在：降低慢性肾病患者血清尿毒症毒素水平，降低慢性肾病患者收缩压和肌酐水平，提高血红蛋白水平，改善慢性肾病患者肠道屏障。