一种基于Python的RMD模拟结果裂解反应路径的统计方法
摘要:
本发明属于计算理论化学技术领域,特别涉及一种基于Python的RMD模拟结果裂解反应路径的统计方法,通过进行RMD计算并得到bond.reaxc键序信息文件,并且利用python语言对文件中的时间、键序信息进行提取存储,通过递归、遍历、正则表达、深度拷贝和嵌套等技术手段以及字典、列表等数据结构,对模拟体系的第一步反应、裂解反应路径等核心关键问题进行统计分析,建立了包含多阶段信息化学模拟数据处理时的逻辑脉络。本发明基于Python对RMD模拟结果裂解反应路径进行统计,相较于人工处理分析,具备数个数量级的效率优势,同时该过程中体现的数据处理逻辑模式对于相似类型的模拟结果的处理具有极大的借鉴意义。(56)对比文件Aravind Krishnamoorthy.et al“.EZFF:Python Library for Multi-ObjectiveParameterization and UncertaintyQuantification of Interatomic Forcefieldsfor Molecular Dynamics”《.web of science》.2021,全文.
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