本发明公开了一种航空发动机高能射线测量装置及其控制系统，包括：中舱，所述中舱内设有放置待测航空发动机的载架；扫描架，设于所述中舱的外侧；射线源和探测器，设于所述扫描架上，并沿所述中舱的外周在周向方向上进行同步旋转或相对旋转，和/或沿所述中舱的外周在轴向方向上进行直线运动。与现有技术相比本发明的有益效果是：可模拟不同环境状态，并可高效地观察和测量发动机不同部位下的内部结构信息如形变、间隙、缺陷等，从而可以及早的发现运行中存在的问题，为设计、改进发动机，提高发动机寿命和可靠性提供重要数据支持。