本申请公开了燃料电池发动机及其箱体及其制造方法和制造系统，所述燃料电池发动机箱体包括箱体本体(10)，所述箱体本体由多个挤压型材围合焊接而成，多个所述挤压型材中包括至少一个第一挤压型材(11)，所述第一挤压型材包括用于围合所述箱体本体的内腔的箱壁部(111)和设置在所述箱壁部的外侧上的支架部(112)。本申请的燃料电池发动机箱体中，围合形成箱体本体的各部分为挤压型材，便于根据箱体本体的设计长度切割为所需尺寸，从而能够更方便地适于燃料电池发动机箱体长度的设计变化。并且，通过挤压成型制作第一挤压型材，可以一体形成支架部和箱壁部，无需在箱体主体上另外安装支架部，简化了工艺，提高了生产效率。