本发明提供一种用于卫星通信系统抗干扰效能评估方法，充分考虑了卫星通信系统抗干扰效能评估的特点，建立了卫星通信系统抗干扰效能评估模型，由此设计的基于最小二乘法的卫星通信系统抗干扰评估算法，能有效地评估出干扰条件下卫星通信系统的通信效能，并通过实际测试验证了该方法的有效性和可行性；且该设计方法简单、具有工程可实现性、可以拓展应用到其他通信系统。经过实际检验测试，该评估方法得出的评估值与测试值较为接近，说明卫星通信系统抗干扰性能的函数拟合是逼真的，建立的模型是有效的。在遇到干扰时，通过卫星通信系统抗干扰能力评估模型可以得出当前干扰下的呼通率指标，可作为卫星通信系统运行决策的重要参考和依据。