本发明公开了一种高通量筛选系统。本发明的筛选系统包括供料装置、反应器、分离装置、分析装置和控制装置。供料装置用于反应溶剂、反应物料的选择和精确计量，反应器用于供反应溶剂、反应物料反应，分析装置用于反应溶剂、反应物料以及产物的表征。控制装置分别控制每一个系统稳定运行，同时对分析系统的数据进行分析，获取较优的反应条件，同时本发明选用多功能连续流反应器作为反应器，不仅可以操作液相反应，也可以通过固载催化剂实现气液固多相的反应，另外管径的增大，也有助于增大反应的通量，对于产业化更具有实际指导意义。