本发明公开一种高通量筛选方法，包括以下步骤：将供液装置内的预设计量的反应溶剂和反应物料输送至反应器内，反应溶剂和反应物料在反应器内反应，生成反应产物后并混合成反应液；将反应器内的反应液输送至分离装置内，以使分离装置对反应液的组分进行分离；将分离后的反应液的组分输送至分析装置内，以使分析装置对反应液的组分进行定性定量分析；根据分析装置的分析结果，通过控制装置筛选出最优的反应条件。控制装置分别控制每一个系统稳定运行，同时对分析装置的数据进行分析，获取较优的反应条件，同时本发明选用连续流反应器作为反应器，具有更大的管路内径，因此增加了反应液的流速，便于产业化的指导需求。