本发明公开一种基于无差拍预测控制的电机电流谐波抑制系统，应用于氢燃料电池汽车，包括电流谐波滤除模块、无差拍预测控制模块、电机控制模块、电流获取模块、SVPWM控制器、三相逆变器以及设有电流传感器的永磁同步电机；电机控制模块用于生成αβ轴电压；SVPWM控制器用于根据αβ轴电压生成空间矢量控制信号；三相逆变器用于根据空间矢量控制信号生成三相电流以驱动永磁同步电机运行；电流获取模块用于根据电流传感器采集的三相电流生成dq轴电流；电流谐波滤除模块用于滤除dq轴电流的全部谐波分量以得到第一dq轴电流；无差拍预测控制模块用于根据第一dq轴电流生成dq轴补偿电压。本发明实现高精度的永磁同步电机谐波滤除功能，达到更好的谐波抑制效果。