本发明公开了一种集装箱船甲醇燃料舱布置结构，其包括甲醇燃料舱；甲醇燃料舱内设有沿着船长方向纵向延伸的分隔舱壁；分隔舱壁为槽型舱壁；槽型舱壁的顶部设有顶墩，槽型舱壁的底部设有底墩；甲醇燃料舱包括燃料舱内壳，燃料舱内壳和燃料舱内壳外部的船体结构件之间设有隔离处所，隔离处所内固设有壳体加强固定构件；燃料舱内壳的内壁不设有突出于燃料舱内壳的构件；槽型舱壁上不设有突出于槽型舱壁的构件；底墩的外表面不设有突出于底墩外表面的构件；顶墩的外表面不设有突出于顶墩外表面的构件。本发明极大地降低了甲醇燃料舱的施工难度，提高了燃料舱内特涂和除气操作效率。