本发明提供了一种边墙电阻率跨孔CT辅助试验装置及其工作方法，包括电缆、变径三通管、法兰、注水阀、管壁上钻有若干个钻眼的套管、置于所述套管末端的止水塞、包裹在套管外壁的土工布、与法兰的法兰盘连接的底盘、以及置于所述套管内的观测管和电缆固定管；所述变径三通管的三端分别用于连接所述套管的顶端、所述法兰的颈部和所述注水阀；所述套管内的观测管和电缆固定管穿过所述底盘伸出所述套管；所述观测管用于观测所述套管中的水位，所述电缆固定管用于固定电缆。能够在不影响电场传播的前提下，实现破碎岩体且钻孔倾斜向上电阻率CT探测。