本发明涉及一种能特异性识别肝素类结构的蛋白探针VAR2HP及其编码基因与应用。本发明提供了一种能特异性识别肝素类结构的蛋白探针VAR2HP，该蛋白在分子水平上只与Hep结合，而与其他糖胺聚糖CS‑A，CS‑C，CS‑E，HA，HS，DS等不结合，专一性强，生物相容性好，无细胞毒性。在作为抗癌药物载体使用时，可与八倍剂量的抗癌药物达到同样的抗癌效果，减少抗癌药物用量后，可以减少抗癌药物对机体的损伤，具有广阔的医药应用前景，在单独使用时，也具有抑制细胞系4T1、HeLa和HuH‑7增殖的能力，表明VAR2HP自身具有抗肿瘤的潜力。