本申请涉及一种侧导流罩控制系统及其控制方法、控制装置和存储介质。侧导流罩控制系统包括：侧导流罩，设置在车辆的驾驶室和货箱之间，侧导流罩包括侧导流罩固定部分、侧导流罩折叠部分和翻转机构，翻转机构的一侧与驾驶室连接，翻转机构的另一侧分别与侧导流罩固定部分、侧导流罩折叠部分连接；其中，在初始状态下，侧导流罩与货箱之间保留有距离，且侧导流罩折叠部分折叠在侧导流罩固定部分的内侧；检测元件，设置在驾驶室的前部，用于检测车辆行驶时的空气流速和车速；控制器，在达到目标翻转时间的情况下，控制侧导流罩折叠部分翻转到与侧导流罩固定部分平齐且靠近货箱的位置。该侧导流罩控制系统能够降低油耗。