本发明提供一种永磁同步电机快速标定方法及系统，包括步骤1，在线数据采集：在整车系统要求的最低工作电压，且在一个固定低转速下扫描不同的、不同组合的电流工作点，回采得到各个电流工作点对应的、、直流母线电压、转速、电机温度、电控IGBT温度；步骤2，离线数据处理：对回采的数据进行离线处理，采用算法寻找出MTPA点、等转矩曲线、等磁链曲线，得到全域的、参考电流表；步骤3，在线修正：应用自动化的寻优工具在线对得到全域的、参考电流表进行修正，达到自动化快速、准确、安全的标定永磁同步电机。