本发明涉及一种加氢机融合控制方法及系统，方法包括：S1、获取氢气加注温度、环境温度、气瓶当前压力、气瓶内氢气当前温度；S2、若单板电脑不存在故障则执行步骤S3，否则执行步骤S5；S3、单板电脑基于气瓶内氢气温度模拟计算公式，计算得到采用不同氢气加注质量流率的模拟加注过程中的时间‑气瓶内氢气温度模拟变化曲线；S4、根据各曲线选取最大氢气加注质量流率，以得到氢气加注上升率控制信息，发送至PLC，执行步骤S6；S5、PLC根据预制控制参数表格，查找得到氢气加注上升率控制信息，执行步骤S6；S6、PLC根据氢气加注上升率控制信息控制加氢机的加氢速率；S7、重复步骤S1‑S6，直至气瓶压力达到目标压力值。可兼顾加氢过程的高效、安全、稳定与智能。