本发明涉及飞机零部件装配制造技术领域，公开了一种反向钻孔的操作方法，包括如下步骤：A、使用磁铁将零部件盲孔内的钻头磁化；B、将铁粉靠近零部件未钻穿的表面，在零部件的表面形成钻头末端形状的铁粉堆；C、根据铁粉堆的顶点进行反向钻孔；本发明的一种反向钻孔的操作方法，不会受到零部件的形状或体积的影响，在零部件未钻穿的表面上能够找到对应的钻孔中心点，避免反向钻孔与原钻孔的轴线相互偏离过大，有效控制了零部件的结构损伤或孔径超差等质量问题的产生，降低了零部件报废的风险。