本发明涉及一种船用浮游植物打捞装置，包括支架系统、收集系统、脱水系统和支撑系统；支架系统包括钢架以及两侧挡板；收集系统包括收集装置与连杆装置，其中收集系统包括滚叉和底板，滚叉将浮游植物进行打捞并在运动过程中与底板相配合将浮游植物留在底板上等待运输，连杆装置将浮游植物运输到脱水系统；脱水系统通过基座安装在支架后半段用于对对浮游植物进行挤压脱水，同时将浮游植物运输至末端落入船舱；支撑系统实现整体装置的固定及角度调整。本发明利用连杆机构与传送带滚筒对浮游植物进行两级脱水与运输，可有效提高浮游植物打捞运输量；同时整体装置可便携拆卸，可安装在不同船只上进行跨水域作业，设备购置以及运输成本低。