本发明提供了一种室内飞机试验微压力控制系统及控制方法，属于飞机测试技术领域。控制系统包括：压力平衡装置、第一新风机组、温度传感器及压差传感器，控制方法包括以下步骤：S1、试验开始前，启动微压力控制系统；S2、设定飞机气候实验室压差控制目标值，判断飞机气候实验室试验工况；S3根据工况对飞机气候实验室内微压力进行调节；S4、试验完成后，关闭微压力控制系统。本发明解决了现有技术无法满足大体积、温湿度变化范围广的飞机气候实验室对于微正压环境要求的问题，具有调控效果好、响应迅速的优点。