本发明公开了一种轨道交通供电系统及其控制方法，该供电系统包括控制子系统和多个供电区间，相邻两供电区间之间连接有多个第一开关单元，每个供电区间用于给多个车站供电；供电区间包括：变电所，用于引入交流市电，并输出多路直流电；多个直流环网，用于接收多路直流电；供配电站，用于将直流环网的电能提供给直流负载；至少一个直流电源，各直流电源对应一个供电子区间，用于给至少一个车站供电，相邻两供电子区间之间连接有多个第二开关单元；控制子系统用于对第一开关单元、变电所、供配电站、直流电源和第二开关单元中的至少一个进行控制。该供电系统能够降低电压等级，减少设备数量及设备体积，降低设备投资，提高电能利用率和供电可靠性。