盾构隧道安全下穿市政桥梁桩基托换系统及其施工方法，本发明涉及市政建设技术领域，在工作平台上施工托换桩，托换桩顶部设置预顶承台，设置临时支架，在桥梁的盖梁底部施作大跨度、井字形上部托换结构梁，进行第一次托换施工，利用被托换桩在河底标高以下施工大跨度、井字形下部托换结构梁，然后施工托换墙至上部托换结构梁的下部，待下部托换结构梁混凝土达到强度后，进行第二次托换施工。其能保证上部桥梁交通的正常通行，避免了由桥梁拆复建所引起巨大的经济损失，又能有效的清除地铁施工的工程障碍，降低地铁盾构下穿的风险，大大减少了地铁施工的工程费用；同时，还尽最大可能地保留原市政桥梁或高架桥的功能需求。