本发明涉及分子诊断技术领域，具体是一种检测肿瘤微卫星不稳定性状态的组合物及其应用，所述组合物由PTMAP4、H3F3AP6、RPL22L1、RP11‑267J23.4、MSH4、LYG1、RP11‑372B4.3、TLE6、RP11‑819M15.2、CIRBP‑AS1、FAM151B、EIF5A、SUMO2P17、FECH、MNX1‑AS1组成。本发明通过运用GSVA算法进行差异分析，获取得到各肿瘤相应的截断值，可用于多种肿瘤的微卫星不稳定性(MSI)状态的检测。通过实验验证，发现该方法具有准确性高、特异性好的优点，有很好的应用前景。