本发明公开了一种生物安全隔离环境的动态控制方法及其设备，包括：进排风系统，固定安装在进、排风管道内，用于采集新风并对新风调温、调湿；环境监测系统，用于采集舱内环境温度、风速、风向和负压数据，时刻监测室内的负压水平，将信息传递给信息处理系统；信息处理系统，接收环境监测系统发来的环境和负压异常数据，进行控制策略计算，并将判断结果发送给反馈控制系统；反馈控制系统，接收信息处理系统发来的结果信息，根据控制策略动态调整室内环境和负压水平。本发明的进排风系统采用多支路并行控制，对每个区域负压水平和温湿度并行控制，提高了负压控制效率和精度，保证了区域间的负压梯度稳定，缩短了新风传输距离，降低了能效损耗。