本发明公开了一种基于神经网络算法的电推平底货船减阻节能控制系统，包括：航速控制模块，用于当电推船开始启动时，设置初始航速，控制电机驱动器使电推船按照设置速度稳定航行；控制参数优化模型，用于使用BP神经网络模型通过建立的数据库预测出最佳控制参数：气泡量、船的倾角；执行模块，用于根据控制参数优化模型的输出结果调整气泡量，使其达到预期气泡量，让船的倾角达到理想值并稳定；功率判断模块，用于检测当前船的消耗功率减小值是否收敛，若收敛，判断船的消耗功率为最小值。本发明有效控制微气泡在实际行驶过程中损耗过多的问题，降低能量损耗，达到节能减排的目的。