本发明公开了一种氨噻肟酸二聚体的高纯度选择性制备和纯化方法，包括如下步骤：A、在低沸点溶剂中加入氨噻肟酸和有机碱，搅拌溶清；B、制备混酐；C、选择性缩合：将步骤A所得氨噻肟酸溶液加入到步骤B所得混酐液体系中，加入催化剂，通过工艺条件的控制减少反式氨噻肟酸二聚体的生成，实现选择性缩合制备高纯度氨噻肟酸二聚体；D、产品纯化。本发明提供的氨噻肟酸二聚体制备和纯化方法，通过选择性缩合反应大大减少了反式异构体的生成，产品收率和纯度均明显提高。