本发明公开了鉴定生物分子链中多对生物分子间相互作用调控因子的方法。本发明在运用多价互作大分子建立相变体系的基础上，创建了重组生物分子链，重组生物分子链间各分子通过环环相扣的相互作用聚集于相变液滴中，可通过将链末端生物分子进行报告基团的标记并检测相变液滴中是否有报告基团的信号的聚集来确定重组生物分子链的上下游分子间形成的生物分子对之间是否有相互作用。在此基础上，通过向体系中加入生物分子互作抑制剂，并通过检测相变液滴中报告基团信号强度的变化实现多靶点生物分子互作抑制剂的同步高通量筛选。本发明的方法操作简便、灵敏度高、成本低廉、适用性广，尤其适用于进行信号通路调控物的筛选。