本发明属于水声通信导航领域，涉及一种基于自适应AKF的单应答器斜距水声定位方法及系统。该系统由应答器、声信号收发器、多普勒流速计、姿态传感器、深度传感器、自适应卡尔曼滤波控制器组成。基于自适应卡尔曼滤波(AKF)算法，整合水下航行器单一斜距信息、深度测量信息、速度信息、姿态信息，且考虑各个传感器的噪声、时间延迟、更新频率和多传感器信息融合，建立水下航行器的单一应答器单一斜距定位方法，计算出水下航行器的三维坐标，实现精确定位。本发明的方法可节省应答器布放与定位作业成本，能够克服受限于声信号在水下传播的速度与距离，斜距测量更新率较慢，与深度、姿态测量信息的更新不同步问题，从而提高定位效率和精度。