一种掘支锚联合机组双截割部控制系统及方法，系统包括压力/位移/电流/转速传感器、PLC控制器、主/副截割部回转/升降油缸、主/副截割部截割电机；通过压力传感器油缸压力进行检测；通过位移传感器对油缸位移量进行检测；通过转速传感器对截割头转速进行检测；PLC控制器用于接收来自压力/位移/电流/转速传感器输出的检测信号，通过PLC控制器对截割臂回转/升降速度、截割电机转速进行调控。方法包括截割轨迹控制方法、截割电机转速控制方法、横摆及纵摆截割载荷平衡控制方法，降低截割头截割过程受到的较大载荷，通过截割轨迹控制方案，可提高截割效率且避免双截割部发生干涉，可平衡双截割部之间横摆和纵摆载荷，减小机身所受到反作用力。