本发明公开了一种船舶推进柴油机双重负荷的保护方法，包括如下步骤：确定负荷限制点数量及每个点的转速和负荷限制功率；调整柴油机的油门位置与主控电流、反馈电流的关系，使之线性可控；稳态测量并记录柴油机负荷限制点的油门位置、主控电流、反馈电流；将所测量的各负荷限制点上的数据设定到柴油机控制系统中，相邻两点间的负荷限制参数按照线性插值方法获得。通过标定推进柴油机的负荷限制，能够对柴油机进行有效的超负荷保护，降低了单一参数漂移对柴油机负荷保护失效的概率，保证了动力系统的安全运行。