本发明涉及一种空间飞行器系统及部署方法，其中空间飞行器系统包括主飞行器(1)和从飞行器(2)；所述主飞行器(1)用于搭载所述从飞行器(2)，并且辅助所述从飞行器(2)进行空间部署；所述从飞行器(2)在所述主飞行器(1)的辅助下进行机动部署至指定位置。通过以主飞行器为主体搭载具有轨道转移能力的从飞行器可以方便快捷地实现从飞行器在空间灵活进行机动部署，从而避免了由地面发射部署过程中程序复杂，响应慢，灵活性差的缺点。同时，从飞行器在完成指定任务后还可通过机动以及主飞行器的辅助重新返回主航天器上，实现了从飞行器能够按照任务需要在空间部署和回收，进一步保证了本发明的空间飞行器系统的灵活性。