本发明公开了一种益生菌发酵枸杞浓浆的制备方法，以鲜枸杞、干枸杞、枸杞粉打浆得到枸杞果浆，控制可溶性固形物含量15—30％，经超微处理，静置酶解，灭菌、接种益生菌于20—45℃保温发酵，自然停止发酵或PH值达到3.0—4.5终止发酵，得益生菌发酵枸杞原汁，益生菌发酵枸杞原汁经分离，得到益生菌发酵枸杞酱，由益生菌发酵枸杞原汁10‑50％和益生菌发酵枸杞酱0‑10％，加入蜂蜜、糖浆或白砂糖若干，稳定剂、柠檬酸钠、香精、异Vc‑Na及低聚糖、叶黄素、牛磺酸、葡萄糖酸锌、Vc等营养强化剂得益生菌发酵枸杞浓浆。本发明得到的发酵枸杞浓浆营养丰富，色泽鲜艳诱人，风味优雅，具有较高的生物活性。