本发明公开了一种椒目中植物化学素的分离方法，包括1）椒目经粉碎、造粒，用4＃剂萃取，得到萃取物和萃余物；萃取物经酯化与分离，得到甘油和混合脂肪酸乙酯。混合脂肪酸乙酯再经吸附分离，得到高纯度α—亚麻酸乙酯和生物柴油；2）步骤1）中的萃余物，用稀乙醇提取，得到乙醇提取液和料粕，乙醇提取液经蒸发浓缩与干燥，得到富含多酚类物质的椒目乙醇提取物。本发明方法工艺流程短而简便，能实现原料的综合全利用和辅料的循环套用，无三废排放，绿色环保，且系列产品的成本低、质量好；技术成熟度高，适用性强；变废为宝的综合效益明显。