本发明属于提高中药材丹参中丹参酮含量的方法，双基因转化提高丹参毛状根丹参酮含量的方法。丹参酮类物质具有抗肿瘤，抗菌消炎，抗氧化，抗动脉粥样硬化等多种药理活性，但是丹参中丹参酮含量低，无法满足医疗需要。本发明从丹参中克隆SmHMGR和SmGGPPS基因，构建含SmHMGR和SmGGPPS基因的表达载体，遗传转化丹参叶片获得转SmHMGR和SmGGPPS基因的丹参毛状根，半定量RT-PCR分析、高效液相色谱法测定丹参酮含量，DPPH清除自由基法测定转基因毛状根中丹参酮的抗氧化活性。本发明优点是：转基因丹参毛状根中丹参酮含量显著提高；丹参酮成本低。生产过程无环境污染。