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公开(公告)号：US20050071334A1
公开(公告)日：2005-03-31
申请号：US10676448
申请日：2003-09-30
申请人： Laxmi Parida , Ajay Royyuru
发明人： Laxmi Parida , Ajay Royyuru
CPC分类号： G06F17/3071 , G06F17/30943 , Y10S707/99932
摘要： Classification of objects using the best boolean expression that represents the most optimal combination of the underlying features is disclosed.
摘要翻译： 公开了使用表示底层特征的最佳组合的最佳布尔表达式的对象的分类。
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2.发明申请公开(公告)号：US20090299649A1
公开(公告)日：2009-12-03
申请号：US12541278
申请日：2009-08-14
IPC分类号： G01N33/48
摘要： Techniques for protein structure analysis are provided. In one aspect, an article of manufacture for characterizing at least a portion of a protein structure comprising amino acid residues is provided. A set of values characterizing the protein structure are determined, wherein each value represents a distance from a center of the protein structure to a center of a given one or more of the amino acid residues. One or more other sets of values characterizing the hydrophobicity of the protein structure are obtained. A Fourier transform is performed on each of the sets of values to obtain transformed values sets. The transformed value sets are compared to correlate the hydrophobicity with the protein structure.
摘要翻译： 提供蛋白质结构分析技术。 在一个方面，提供了用于表征包含氨基酸残基的蛋白质结构的至少一部分的制品。 确定表征蛋白质结构的一组值，其中每个值表示从蛋白质结构的中心到给定的一个或多个氨基酸残基的中心的距离。 获得表征蛋白质结构的疏水性的一个或多个其它值。 对每组值执行傅里叶变换，以获得变换值集合。 将转化的值集合进行比较，以将疏水性与蛋白质结构相关联。
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公开(公告)号：US08010332B2
公开(公告)日：2011-08-30
申请号：US12540540
申请日：2009-08-13
CPC分类号： G06F19/16
摘要： Techniques for protein structure analysis are provided. In one aspect, an apparatus for characterizing a multi-domain protein structure comprises the following steps. For at least one domain, a hydrophobic dipole, e.g., defined as a first-order hydrophobic moment of the domain, is calculated. A score representing the orientation of the hydrophobic dipole of the at least one domain relative to a hydrophobic dipole of one or more other domains of the multi-domain protein structure is then calculated.
摘要翻译： 提供蛋白质结构分析技术。 一方面，用于表征多结构域蛋白质结构的装置包括以下步骤。 对于至少一个结构域，计算疏水性偶极子，例如定义为该域的一级疏水力矩。 然后计算表示至少一个结构域相对于多结构域蛋白质结构的一个或多个其他结构域的疏水性偶极子的疏水偶极子的取向的分数。
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4.发明申请公开(公告)号：US20060025928A1
公开(公告)日：2006-02-02
申请号：US10901527
申请日：2004-07-29
申请人： Ajay Royyuru , Benjamin Silverman , Ruhong Zhou
发明人： Ajay Royyuru , Benjamin Silverman , Ruhong Zhou
摘要： Techniques for protein structure analysis are provided. In one aspect, a method of characterizing at least a portion of a protein structure comprising amino acid residues comprises the following steps. A set of values characterizing the protein structure are determined, wherein each value represents a distance from a center of the protein structure to a center of a given one or more of the amino acid residues. One or more other sets of values characterizing the hydrophobicity of the protein structure are obtained. A Fourier transform is performed on each of the sets of values to obtain transformed values sets. The transformed value sets are compared to correlate the hydrophobicity with the protein structure.
摘要翻译： 提供蛋白质结构分析技术。 一方面，表征包含氨基酸残基的蛋白质结构的至少一部分的方法包括以下步骤。 确定表征蛋白质结构的一组值，其中每个值表示从蛋白质结构的中心到给定的一个或多个氨基酸残基的中心的距离。 获得表征蛋白质结构的疏水性的一个或多个其它值。 对每组值执行傅里叶变换，以获得变换值集合。 将转化的值集合进行比较，以将疏水性与蛋白质结构相关联。
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5.发明申请公开(公告)号：US20090299648A1
公开(公告)日：2009-12-03
申请号：US12541273
申请日：2009-08-14
IPC分类号： G01N33/48
摘要： Techniques for protein structure analysis are provided. In one aspect, an apparatus for characterizing at least a portion of a protein structure comprising amino acid residues is provided. A set of values characterizing the protein structure are determined, wherein each value represents a distance from a center of the protein structure to a center of a given one or more of the amino acid residues. One or more other sets of values characterizing the hydrophobicity of the protein structure are obtained. A Fourier transform is performed on each of the sets of values to obtain transformed values sets. The transformed value sets are compared to correlate the hydrophobicity with the protein structure.
摘要翻译： 提供蛋白质结构分析技术。 在一个方面，提供了用于表征包含氨基酸残基的蛋白质结构的至少一部分的装置。 确定表征蛋白质结构的一组值，其中每个值表示从蛋白质结构的中心到给定的一个或多个氨基酸残基的中心的距离。 获得表征蛋白质结构的疏水性的一个或多个其它值。 对每组值执行傅里叶变换，以获得变换值集合。 将转化的值集合进行比较，以将疏水性与蛋白质结构相关联。
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公开(公告)号：US20060041391A1
公开(公告)日：2006-02-23
申请号：US10921493
申请日：2004-08-19
申请人： Prasanna Athma , Ajay Royyuru , Benjamin Silverman , Ruhong Zhou
发明人： Prasanna Athma , Ajay Royyuru , Benjamin Silverman , Ruhong Zhou
IPC分类号： G06F19/00
CPC分类号： G06F19/16
摘要： Techniques for protein structure analysis are provided. In one aspect, a method of analyzing a multi-domain protein structure comprises the following steps. For at least one domain, a hydrophobic dipole, e.g., defined as a first-order hydrophobic moment of the domain, is calculated. A score representing the orientation of the hydrophobic dipole of the at least one domain relative to a hydrophobic dipole of one or more other domains of the multi-domain protein structure is then calculated.
摘要翻译： 提供蛋白质结构分析技术。 一方面，分析多结构域蛋白质结构的方法包括以下步骤。 对于至少一个结构域，计算疏水偶极子，例如定义为该域的一级疏水力矩。 然后计算表示至少一个结构域相对于多结构域蛋白质结构的一个或多个其他结构域的疏水性偶极子的疏水偶极子的取向的分数。
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公开(公告)号：US07877214B2
公开(公告)日：2011-01-25
申请号：US10921493
申请日：2004-08-19
CPC分类号： G06F19/16
摘要： Techniques for protein structure analysis are provided. In one aspect, a method of analyzing a multi-domain protein structure comprises the following steps. For at least one domain, a hydrophobic dipole, e.g., defined as a first-order hydrophobic moment of the domain, is calculated. A score representing the orientation of the hydrophobic dipole of the at least one domain relative to a hydrophobic dipole of one or more other domains of the multi-domain protein structure is then calculated.
摘要翻译： 提供蛋白质结构分析技术。 一方面，分析多结构域蛋白质结构的方法包括以下步骤。 对于至少一个结构域，计算疏水性偶极子，例如定义为该域的一级疏水力矩。 然后计算表示至少一个结构域相对于多结构域蛋白质结构的一个或多个其他结构域的疏水性偶极子的疏水偶极子的取向的分数。
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公开(公告)号：US20090306904A1
公开(公告)日：2009-12-10
申请号：US12540540
申请日：2009-08-13
IPC分类号： G06F19/00
CPC分类号： G06F19/16
摘要： Techniques for protein structure analysis are provided. In one aspect, an apparatus for characterizing a multi-domain protein structure comprises the following steps. For at least one domain, a hydrophobic dipole, e.g., defined as a first-order hydrophobic moment of the domain, is calculated. A score representing the orientation of the hydrophobic dipole of the at least one domain relative to a hydrophobic dipole of one or more other domains of the multi-domain protein structure is then calculated.
摘要翻译： 提供蛋白质结构分析技术。 一方面，用于表征多结构域蛋白质结构的装置包括以下步骤。 对于至少一个结构域，计算疏水性偶极子，例如定义为该域的一级疏水力矩。 然后计算表示至少一个结构域相对于多结构域蛋白质结构的一个或多个其他结构域的疏水性偶极子的疏水偶极子的取向的分数。
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9.发明申请Techniques for reconstructing supply chain networks using pair-wise correlation analysis 失效使用成对相关分析重建供应链网络的技术公开(公告)号：US20050096958A1
公开(公告)日：2005-05-05
申请号：US10699373
申请日：2003-10-31
申请人： J. Rice , Ajay Royyuru , Gustavo Stolovitzky , Yuhai Tu
发明人： J. Rice , Ajay Royyuru , Gustavo Stolovitzky , Yuhai Tu
CPC分类号： G06Q10/04 , G06Q10/087
摘要： Techniques for reconstructing networks are provided. In one aspect, a method for reconstructing a synthetic network, such as a synthetic biological network, is provided. In another aspect, a method for reconstructing a supply chain network is provided. Exemplary supply chain networks include supply chains for petroleum distribution.
摘要翻译： 提供了重建网络的技术。 一方面，提供了一种用于重建诸如合成生物网络的合成网络的方法。 另一方面，提供一种重建供应链网络的方法。 示例性供应链网络包括石油分销供应链。
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