公开(公告)号：CN119560016A

公开(公告)日：2025-03-04

申请号：CN202411771816.4

申请日：2024-12-03

Applicant: 重庆交通大学

Inventor： 江飞燕 ,  陈晓丰 ,  肖雄涛 ,  张凇铭 ,  谭铖 ,  高张阳

IPC: G16B25/00 ,  G16B40/00 ,  G06N3/042 ,  G06N3/045 ,  G06F18/23 ,  G06F18/22 ,  G06N3/048 ,  G06N3/0985 ,  G06F18/213 ,  G06F18/25

Abstract: 本发明提出了一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，该算法通过构建空间邻居图和基因表达相似图来整合局部和全局信息，并利用图神经网络和注意机制进行特征提取和聚类，实现对空间域的准确识别。首先根据点的空间位置信息构建空间邻居图。同时，根据基因表达计算每个点的余弦相似度，构建基因表达相似图。然后将这两张图作为图注意力自动编码器的输入，通过编码器提取具有空间信息和基因表达的低维特征向量。通过注意机制对两个图的低维嵌入特征向量给予特别关注，并根据一定的权重对它们进行线性组合。通过融合空间图和表达图的特征来有效地平衡了空间上下文与基因表达数据。将其解码并反转回原始特征空间，重建基因表达矩阵。最后，学习到的低维嵌入可以用于一系列下游任务，如空间域识别。