一种检测土壤中盐生链霉菌特异性引物及其设计方法和应用

    公开(公告)号:CN118006804A

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202311709007.6

    申请日:2023-12-13

    Applicant: 辽宁大学

    Abstract: 本发明属于微生物技术领域,具体涉及一种检测土壤中盐生链霉菌特异性引物及其设计方法和应用。首先通过高通量测序技术获得盐生链霉菌菌株(Streptomyces sp.Lnu‑12)全基因组序列,将全基因组序列在NCBI数据库中逐一对比,找到与其他基因组完全不匹配的特异性序列,根据特异性序列设计特异性引物,并通过亲缘关系相近的菌株检测引物的特异性,通过在土壤中添加不同次方的菌株检测引物的灵敏度,最终筛选到最特异性和灵敏度最好的引物F3。本发明明确了具有广谱抑菌活性的生防菌株盐生链霉菌Lnu‑12特异性引物的设计方法,可检测植物根际Lnu‑12的定殖数量,指导生产实践。

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