公开(公告)号：CN119724367B

公开(公告)日：2025-04-22

申请号：CN202510201883.0

申请日：2025-02-24

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 毛锐 ,  王业强 ,  赵文潇 ,  何伊俊 ,  李文双 ,  丁敏翔 ,  李佳乐

IPC: G16B40/00 ,  G16B15/20 ,  G16B20/00 ,  G16B30/10 ,  G06N3/042 ,  G06N3/045 ,  G06N3/084 ,  G06N3/0985 ,  G06N5/01 ,  G06F18/22 ,  G06F18/2413 ,  G06F18/25

Abstract: 本发明涉及基因编辑领域和人工智能领域，公开了一种基于图神经网络的Anti‑CRISPR蛋白识别方法。该方法通过构建异构网络对蛋白质之间的相似关系进行建模，利用图神经网络学习蛋白质特征，从而实现对Anti‑CRISPR蛋白的识别。本方法通过整合多种蛋白特征，包括组成特征、进化特征、重复和分布特征、序列相关性特征、结构相关特征以及ESM‑2蛋白质语言模型生成的嵌入表示，并结合图注意力机制（GAT）和基于空域的图神经网络（GraphSAGE），提高了识别性能。本发明在多个基准测试上表现出优异的准确性和鲁棒性，尤其在独立测试数据集上展现出更高的识别准确性，能够有效区分正负样本。此模型在Anti‑CRISPR蛋白的研究中具有重要的应用价值。

公开(公告)号：CN119724367A

公开(公告)日：2025-03-28

申请号：CN202510201883.0

申请日：2025-02-24

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 毛锐 ,  王业强 ,  赵文潇 ,  何伊俊 ,  李文双 ,  丁敏翔 ,  李佳乐

IPC: G16B40/00 ,  G16B15/20 ,  G16B20/00 ,  G16B30/10 ,  G06N3/042 ,  G06N3/045 ,  G06N3/084 ,  G06N3/0985 ,  G06N5/01 ,  G06F18/22 ,  G06F18/2413 ,  G06F18/25

Abstract: 本发明涉及基因编辑领域和人工智能领域，公开了一种基于图神经网络的Anti‑CRISPR蛋白识别方法。该方法通过构建异构网络对蛋白质之间的相似关系进行建模，利用图神经网络学习蛋白质特征，从而实现对Anti‑CRISPR蛋白的识别。本方法通过整合多种蛋白特征，包括组成特征、进化特征、重复和分布特征、序列相关性特征、结构相关特征以及ESM‑2蛋白质语言模型生成的嵌入表示，并结合图注意力机制（GAT）和基于空域的图神经网络（GraphSAGE），提高了识别性能。本发明在多个基准测试上表现出优异的准确性和鲁棒性，尤其在独立测试数据集上展现出更高的识别准确性，能够有效区分正负样本。此模型在Anti‑CRISPR蛋白的研究中具有重要的应用价值。