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发明公开
一种基于cgMLST的变异链球菌分型方法无效

公开(公告)号：CN112053744A

公开(公告)日：2020-12-08

申请号：CN202010718046.2

申请日：2020-07-23

Applicant: 蚌埠医学院第一附属医院(蚌埠医学院附属肿瘤医院)

Inventor： 刘姗姗 , 张凯 , 陈永锋

IPC: G16B20/30 , G16B30/00 , G16B40/00 , C12Q1/6869 , C12Q1/689

Abstract: 本发明属于细菌分型技术领域，具体涉及一种基于cgMLST的变异链球菌分型方法，包括原始cgMLST靶基因集的构建、获取候选基因组、获取有效cgMLST靶基因、获取基因样品全基因组信息、评估变异链球菌cgMLST的分辨率。本发明相比现有技术具有以下优点：本发明中实现对变异链球菌cgMLST的分辨率的评估，验证cgMLST能对变异链球菌有效分型，解决了MLST分型对亲缘关系近的变异链球菌分离株的分型效果较差的问题，应用于变异链球菌的传播分析，能够更有效、更可靠的鉴别变异链球菌菌株，对龋病的防治有重要意义。

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