一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用

    公开(公告)号:CN114457142A

    公开(公告)日:2022-05-10

    申请号:CN202210176147.0

    申请日:2022-02-25

    Abstract: 本发明提供一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用。该方法通过加热总RNA变性成单链RNA;对单链RNA的3'端加A尾;使用oligo(dT)10‑RT将RNA逆转录成cDNA;以cDNA为模板将病毒基因组各分段的两端划分为5'端区域和3'端区域进行Multiplex PCR;跑胶回收目的条带并将其连接至克隆载体后进行测序,获得基因组的全部末端序列。该方法对样品的RNA质量要求低,oligo(dT)10‑RT与Anchor24‑F引物在dsRNA病毒基因组末端序列鉴定上可通同,适用于批量获得dsRNA病毒基因组末端序列,将有助于未知的dsRNA基因组全长序列的获得。

    辣椒脉斑驳病毒多基因联合检测鉴定方法

    公开(公告)号:CN111808992A

    公开(公告)日:2020-10-23

    申请号:CN202010681921.4

    申请日:2020-07-15

    Abstract: 本发明提供辣椒脉斑驳病毒多基因联合检测鉴定方法,属于植物病毒检测领域,其采用了两个引物对CP337-F/CP337-R、CI655-F/CI655-R,建立基于ChiVMV外壳蛋白(CP)与细胞质内含体(CI)两个基因的多基因联合检测体系。该方法不仅具有良好的特异性,而且灵敏度与单一RT-PCR的灵敏度相当,均为10-4数量级,显示出良好的检测灵敏度。本发明建立的多基因联合检测体系能在一个反应中同时检测出ChiVMV的CP及CI基因保守区片段,可以满足口岸进出境和农业生产上辣椒脉斑驳病毒的快速、准确检测需求。

    一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用

    公开(公告)号:CN114457142B

    公开(公告)日:2024-07-26

    申请号:CN202210176147.0

    申请日:2022-02-25

    Abstract: 本发明提供一种高效加尾快速扩增植物dsRNA病毒基因组末端序列的方法及其应用。该方法通过加热总RNA变性成单链RNA;对单链RNA的3'端加A尾;使用oligo(dT)10‑RT将RNA逆转录成cDNA;以cDNA为模板将病毒基因组各分段的两端划分为5'端区域和3'端区域进行Multiplex PCR;跑胶回收目的条带并将其连接至克隆载体后进行测序,获得基因组的全部末端序列。该方法对样品的RNA质量要求低,oligo(dT)10‑RT与Anchor24‑F引物在dsRNA病毒基因组末端序列鉴定上可通同,适用于批量获得dsRNA病毒基因组末端序列,将有助于未知的dsRNA基因组全长序列的获得。

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