公开(公告)号：CN108875306A

公开(公告)日：2018-11-23

申请号：CN201810551156.7

申请日：2018-05-31

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 何玮毅 ,  詹东亮 ,  尤民生

IPC: G06F19/20 ,  G06F19/24

Abstract: 本发明公开了一种查找性别决定序列的方法及系统，该查找性别决定序列的方法包括：将多个雌性或雄性的样品进行测序，获得数据，以及将数据比对上参考基因组，获得比对结果，其中，参考基因组包括：性别决定染色体Y或W的序列；处理比对结果，得到每个碱基的测序深度；将数据比对上的基因组分成至少一个窗口，以及对多个雌性或雄性计算至少一个窗口中的每一窗口的碱基覆盖度；对每一窗口，统计多个雄性或雌性样品的平均碱基覆盖度；根据平均碱基覆盖度，确定多个雌性或雄性的样品的性别决定序列。

公开(公告)号：CN108715891A

公开(公告)日：2018-10-30

申请号：CN201810551976.6

申请日：2018-05-31

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 何玮毅 ,  詹东亮 ,  尤民生

IPC: C12Q1/6869 ,  G06F19/20

Abstract: 本发明公开了一种转录组数据的表达定量方法及系统，该转录组数据的表达定量方法包括：将转录组样品进行测序，获得数据，以及将数据比对上参考基因组，获得比对结果；处理比对结果，得到单碱基的测序深度；根据单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度；根据外显子平均测序深度进行聚类，确定内参基因；根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度，将转录组数据进行归一化定量。

公开(公告)号：CN108715891B

公开(公告)日：2021-09-24

申请号：CN201810551976.6

申请日：2018-05-31

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 何玮毅 ,  詹东亮 ,  尤民生

IPC: C12Q1/6869 ,  G16B30/10 ,  G16B40/30

Abstract: 本发明公开了一种转录组数据的表达定量方法及系统，该转录组数据的表达定量方法包括：将转录组样品进行测序，获得数据，以及将数据比对上参考基因组，获得比对结果；处理比对结果，得到单碱基的测序深度；根据单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度；根据外显子平均测序深度进行聚类，确定内参基因；根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度，将转录组数据进行归一化定量。