公开(公告)号：CN103436615B

公开(公告)日：2014-12-31

申请号：CN201310372313.5

申请日：2013-08-24

Applicant: 福州大学

Inventor： 倪莉 ,  黄志清 ,  陈芳 ,  黄山 ,  靳爽

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明公开了一种PCR-DGGE\TGGE\SSCP引物的筛选方法，从所研究的微生物生态体系的菌群序列特性出发进行PCR-DGGE\TGGE\SSCP引物筛选，筛选指标包括引物对的匹配情况及其扩增片段的区分度、平均差异度、平均长度和平均GC含量，最适的引物对是通过综合比较各引物对之间指标的优劣来确定的。本发明选取的引物具有很强的针对性同时无需进行繁琐的多引物筛选或联用的实验操作工作，有助于采用PCR-DGGE\TGGE\SSCP技术对所研究微生态体系的菌群多样性进行快速而准确的解析。

公开(公告)号：CN102978292A

公开(公告)日：2013-03-20

申请号：CN201210573873.2

申请日：2012-12-26

Applicant: 福州大学

Inventor： 倪莉 ,  黄志清 ,  黄山 ,  靳爽

IPC: C12Q1/68 ,  C12R1/865

Abstract: 本发明提供了一种不基于GC夹板策略的特定18SrDNA片段的DGGE/TGGE分析方法，所述特定18SrDNA片段是指包含18SrDNA远离ITS序列的末端区域的片段，以Saccharomycescerevisiae标准菌株NCYC505的18SrDNA序列为参照，所述18SrDNA远离ITS序列的末端区域相当于其起于第1到第30位点范围内任一核苷酸止于第291位点核苷酸的片段。本发明采用特定18SrDNA片段的DGGE/TGGE分析无需GC夹板，就可以在相同条件下获得同带有GC夹板一致的结果，因此可以节约实验成本、减少实验操作步骤。

公开(公告)号：CN102978292B

公开(公告)日：2014-12-03

申请号：CN201210573873.2

申请日：2012-12-26

Applicant: 福州大学

Inventor： 倪莉 ,  黄志清 ,  黄山 ,  靳爽

IPC: C12Q1/68 ,  C12R1/865

Abstract: 本发明提供了一种不基于GC夹板策略的特定18SrDNA片段的DGGE/TGGE分析方法，所述特定18SrDNA片段是指包含18SrDNA远离ITS序列的末端区域的片段，以Saccharomyces cerevisiae标准菌株NCYC505的18SrDNA序列为参照，所述18SrDNA远离ITS序列的末端区域相当于其起于第1到第30位点范围内任一核苷酸止于第291位点核苷酸的片段。本发明采用特定18SrDNA片段的DGGE/TGGE分析无需GC夹板，就可以在相同条件下获得同带有GC夹板一致的结果，因此可以节约实验成本、减少实验操作步骤。

公开(公告)号：CN103436615A

公开(公告)日：2013-12-11

申请号：CN201310372313.5

申请日：2013-08-24

Applicant: 福州大学

Inventor： 倪莉 ,  黄志清 ,  陈芳 ,  黄山 ,  靳爽

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明公开了一种PCR-DGGE\TGGE\SSCP引物的筛选方法，从所研究的微生物生态体系的菌群序列特性出发进行PCR-DGGE\TGGE\SSCP引物筛选，筛选指标包括引物对的匹配情况及其扩增片段的区分度、平均差异度、平均长度和平均GC含量，最适的引物对是通过综合比较各引物对之间指标的优劣来确定的。本发明选取的引物具有很强的针对性同时无需进行繁琐的多引物筛选或联用的实验操作工作，有助于采用PCR-DGGE\TGGE\SSCP技术对所研究微生态体系的菌群多样性进行快速而准确的解析。