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公开(公告)号:CN114613438B
公开(公告)日:2023-05-26
申请号:CN202210219782.2
申请日:2022-03-08
Applicant: 电子科技大学
Abstract: 本发明提供了一种miRNA与疾病的关联预测方法及系统,属于miRNA与疾病的关联预测技术领域。首先在相似度矩阵生成过程中融合其他生物学数据来计算miRNA和疾病的高斯谱核相似度,根据功能或语义相似度的miRNA或疾病所占的比重来计算相似度融合的权重,得到更加合理的综合相似度矩阵;基于归纳矩阵分解,对原始矩阵的模拟分解为两个参数矩阵,并设计双流生成器,生成低秩的相似度投影系数矩阵;添加Dropout层以保证生成矩阵的稀疏性,最后,对多次生成结果取均值获得最终的miRNA疾病关联预测结果,获得更高的miRNA与疾病关联预测能力和预测的可靠性,为科研人员确定疾病关联的候选miRNA提供辅助决策。
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公开(公告)号:CN114613438A
公开(公告)日:2022-06-10
申请号:CN202210219782.2
申请日:2022-03-08
Applicant: 电子科技大学
Abstract: 本发明提供了一种miRNA与疾病的关联预测方法及系统,属于miRNA与疾病的关联预测技术领域。首先在相似度矩阵生成过程中融合其他生物学数据来计算miRNA和疾病的高斯谱核相似度,根据功能或语义相似度的miRNA或疾病所占的比重来计算相似度融合的权重,得到更加合理的综合相似度矩阵;基于归纳矩阵分解,对原始矩阵的模拟分解为两个参数矩阵,并设计双流生成器,生成低秩的相似度投影系数矩阵;添加Dropout层以保证生成矩阵的稀疏性,最后,对多次生成结果取均值获得最终的miRNA疾病关联预测结果,获得更高的miRNA与疾病关联预测能力和预测的可靠性,为科研人员确定疾病关联的候选miRNA提供辅助决策。
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公开(公告)号:CN114613437A
公开(公告)日:2022-06-10
申请号:CN202210219713.1
申请日:2022-03-08
Applicant: 电子科技大学
Abstract: 本发明提供了一种基于异构图的miRNA与疾病关联预测方法及系统,属于疾病关联预测技术领域,该方法将已知关联与miRNA相似度、疾病相似度结合构建异构图,首次在异构图上设计了层间具有可变权重的消息传递函数,设计了结合miRNA和疾病相似度的消息聚合函数,经过异构图神经网络的消息聚合,融合了异构图的高阶拓扑特征,得到miRNA和疾病的最终特征向量表示,最后通过归纳矩阵分解得到miRNA疾病关联预测矩阵,并基于miRNA疾病关联预测矩阵预测未知的miRNA与疾病的关联,提升预测结果的可信度。
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公开(公告)号:CN114613437B
公开(公告)日:2023-05-26
申请号:CN202210219713.1
申请日:2022-03-08
Applicant: 电子科技大学
Abstract: 本发明提供了一种基于异构图的miRNA与疾病关联预测方法及系统,属于疾病关联预测技术领域,该方法将已知关联与miRNA相似度、疾病相似度结合构建异构图,首次在异构图上设计了层间具有可变权重的消息传递函数,设计了结合miRNA和疾病相似度的消息聚合函数,经过异构图神经网络的消息聚合,融合了异构图的高阶拓扑特征,得到miRNA和疾病的最终特征向量表示,最后通过归纳矩阵分解得到miRNA疾病关联预测矩阵,并基于miRNA疾病关联预测矩阵预测未知的miRNA与疾病的关联,提升预测结果的可信度。
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