公开(公告)号：CN111662997B

公开(公告)日：2022-02-25

申请号：CN202010405191.5

申请日：2020-05-14

Applicant: 湖南杂交水稻研究中心

Inventor： 邢俊杰 ,  彭海 ,  邓华凤 ,  彭志荣 ,  石银丰

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11 ,  G16B20/30 ,  G16B25/20

公开(公告)号：CN111662997A

公开(公告)日：2020-09-15

申请号：CN202010405191.5

申请日：2020-05-14

Applicant: 湖南杂交水稻研究中心

Inventor： 邢俊杰 ,  彭海 ,  邓华凤 ,  彭志荣 ,  石银丰

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11 ,  G16B20/30 ,  G16B25/20

Abstract: 本发明涉及一种鉴定水稻稻瘟病菌的引物组及其筛选方法和应用。所述引物组包括正向引物和反向引物，引物组中的多个引物的序列如序列表中SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:200所示。所述引物组的筛选方法，包括：1)将稻瘟病菌的基因组序作为查询序列，并与基因组序列数据库进行比对，将所有基因组序列比对整齐；2)沿着比对整齐的基因组序列做平移；每平移一次对窗口内多个稻瘟病菌的基因组片段进行两两比较，留下有区分度的基因片段作为候选标记位点；3)对每个候选标记位点在多个基因组间的保守区域进行引物设计；4)筛选出引物组。该引物组能够准确且低成本鉴定水稻稻瘟病菌。本发明还包括上述引物组的应用。