一种毒力因子和抗生素抗性基因的混合预测方法

    公开(公告)号:CN115171792A

    公开(公告)日:2022-10-11

    申请号:CN202210781902.8

    申请日:2022-06-30

    Applicant: 湖南大学

    Abstract: 本发明公开了深度学习和生物信息学技术领域的一种毒力因子和抗生素抗性基因的混合预测方法,该毒力因子和抗生素抗性基因的混合预测方法包括以下步骤:S1.分别从数据库中获取已知的抗生素抗性基因序列数据、毒力因子序列数据以及负样本基因序列数据;S2.利用基因序列信息分别计算多种核心基因特征,构建深度学习神经网络架构和经典集成学习架构;S3.将S1中三类序列数据作为样本,划分中训练数据集和测试数据集;S4.利用多种分类方法获取新的训练数据集;对新的训练数据集构建分类模型,获取分类模型的性能评价指标。该毒力因子和抗生素抗性基因的混合预测方法预测效果好、预测准确率较高。

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